久しぶりにCytoscapeを使ってネットワーク描画.
読み込んだネットワークの統計量を知りたい場合は,
Plugins > Network Analysis > Analyze Network で,
クラスター係数,平均経路長などもろもろ計算できる.

また,重複リンクや自己ループリンクの削除は,
Plugins > Network Modifications > Remove Duplicated Edges (Self-Loops)
などで実行する.


意外と便利.リンク数分布も簡単に描画して,画像出力できる.